在公务用车管理中，配备给部使用专车是为保障部工作需要而设立. 根据《党政机关厉行节约反对浪费条例》规定，严格按照规定使用公务用车是必要. 公务用车应该严禁挪用或固定给个人使用执法执勤、机要通信等用车，并且部亲属和身边不得因私使用配备给部公务用车. 部需要树立公车公用意识，区分公私，不能将配备和使用公车视为个人待遇和地位象征，更不能为亲属谋取特殊待遇. 否则，违反相关规定部将受到纪律处分，甚至面临撤销党内职务处罚。

公务用车管理系统建立和运行对于规范公车使用至关重要. 这个系统可以帮助机关单位实现对公车全面管理，确保公车使用符合规定. 同时，公务用车管理系统还可以实时监控公车使用情况，确保公车不被私自使用或滥用。这对于防止公车私用问题发生具有重要意义。

在处理违规谋求特殊待遇与违反具体规定之间关系时，根据《党纪处分条例》规定，党员部为人、亲属和其他特定关系人谋求特殊利益行为应受到纪律处分. 如果党员部为人、亲属和其他特定关系人谋求特殊待遇同时，违反了其他具体条款规定，就应根据具体情况进行择一重处分.

举个例子来说，如果部将单位配备公务用车私自提供给不该使用公车亲属，这就属于公车私用行为，应根据《党纪处分条例》第一百零七条规定进行处理. 而对于条例中没有明确规定情况，比如在交通、医疗、住房、警卫、休假等方面为人、配偶、子女及其亲属谋求特殊待遇行为，应根据《党纪处分条例》第九十九条规定进行处分.

因此，公务用车管理系统建立和运行是非常必要，它可以通过对公车使用情况监控和管理，有效防止公车私用问题发生，公务用车正常使用秩序，提高公务用车管理透明度和规范. 只有加强公务用车管理，严格遵守相关规定，才能更好地发挥公务用车作用，为部工作提供便利，同时树立良好公务形象. 。